Первая волна сталинских депортаций началась в ночь с 12 на 13 июня 1941 года. Десятки тысяч людей из Бессарабии и Северной Буковины были посажены в товарные поезда и насильно вывезены в Сибирь и Казахстан. Большинство из них были «кулаками», священниками, представителями интеллигенции и членами партий. Многие не выжили в суровых условиях, их семьи были разлучены и с ними обращались бесчеловечно.
В результате соглашения между Гитлером и Сталиным, Советский Союз аннексировал территорию, расположенную между реками Прут и Днестр. Под давлением Пакта Риббентропа-Молотова, подписанного 23 августа 1939 года, Румыния была вынуждена уступить Бессарабию, Северную Буковину и область Герца. На оккупированных территориях советские власти начали беспрецедентную кампанию чисток, террора и репрессий. Тех, кого считали опасными, арестовывали и отправляли в исправительно-трудовые лагеря — ГУЛАГ, в самые отдаленные регионы СССР.
Мучения начались в ночь с 12 на 13 июня 1941 года, в 2:30 утра, в момент, который вошел в историю как начало первой волны сталинских депортаций в Бессарабии. В ходе первой волны были депортированы почти 22 тыс. человек из 3470 семей.
Списки депортированных составлялись с многочисленными нарушениями — рукописные, без печатей и официального утверждения со стороны какого-либо государственного учреждения. Были депортированы наиболее активные представители местного населения – мэры, офицеры, помещики, купцы, полицейские, интеллигенция и их семьи.
Поездка на поезде длилась до трех недель и проходила в нечеловеческих условиях в разгар лета: каждому депортированному давали 200 граммов воды в день и только соленую рыбу в пищу. Каждый раз, когда поезд останавливался, тела выбрасывали в поле и либо закапывали в неглубокую могилу, либо оставляли на корм животным. Тех, кто добирался до места назначения, направляли на работу в лесозаготовительные предприятия, в совхозы и ремесленные артели.
Главными жертвами депортаций были те, кто нашел убежище в Бессарабии, а также те, кто приехал из других регионов СССР, спасаясь от советской власти. Главы семей были отправлены в ГУЛАГ, откуда выжили крайне немногие. Их семьи были депортированы в Сибирь или в степи Северного Казахстана. Фактически, одной из целей депортаций было заселение Сибири.
Депортации привели к распаду общин, обнищанию сел и укоренения состояния страха и недоверия, что глубоко повлияло на социальную структуру региона и его идентичность. В течение многих лет никому не разрешалось говорить обо всем, что произошло.
После депортаций 1941 года последовали еще две волны массовых депортаций из Молдовы.
Операция, проведенная с 5 на 6 июля 1949 года была квалифицирована как экономическое наступление, поскольку в Сибирь были отправлены более или менее обеспеченные люди. Духовно-идеологическая волна была третьей и прошла с 31 марта по 1 апреля 1951 года.
Хотя по советским данным в 1941-1951 годах было депортировано около 70 тыс. человек, их число было гораздо больше, утверждают молдавские историки.
